Kardiologian alalla terapeuttisen afereesin tekniikoita voidaan käyttää tiettyjen erittäin haastavien ja tärkeiden kliinisten käyttöaiheiden hoitoon. Joissakin käyttöaiheissa terapeuttisen afereesin tehokkuus on jo selkeästi todistettu, ja joissakin käyttöaiheissa tehdään tutkimuksia parhaillaan. Ehdottomasti kattavin kokemus on saatu lipoproteiiniafereesin käytöstä. Sen sijaan immunoadsorption käyttö dilatoivan kardiomyopatian hoitoon on edelleen yksi tarkasteltavista aiheista. Uusi käyttöaihe on C-reaktiivisen proteiinin vähentäminen sydäninfarktin jälkeen. Fresenius Medical Care tutkii käyttömahdollisuuksia tämän käyttöaiheen osalta yhteistyössä Berliinissä toimivan Pentracorin kanssa.